日本中を感動で包んだ『容疑者Xの献身』に続く映画『ガリレオ』第二弾！
福山雅治＝湯川学が映画で挑むシリーズ史上最も切ない「謎」の方程式。
2013年最大の感動超大作。

手つかずの美しい海が残る波璃ヶ浦。その海底鉱物資源の開発計画の説明会に招かれた湯川は、旅館「緑岩荘」に滞在することに。
そこで湯川は一人の少年・恭平と出会う。恭平は親の都合で、夏休みを伯母一家が経営する旅館で過ごすことになったという。翌朝、堤防下の岩場で男性の変死体が発見された。
男は旅館のもう一人の宿泊客・塚原。これは事故か、殺人か・・・
思わぬ形で事件に巻き込まれていく恭平、環境保護活動にのめりこむ旅館の一人娘・成実。観光業がふるわず廃業を考える伯母夫婦。死んだ塚原はなぜこの町にやってきたのか。事件を巡る複雑な因縁が、次第に明らかになっていく。そして湯川が気づいてしまった事件の哀しき真相とは----